· 洁净度等级划分：根据实验类型和研究需求，微生物实验室的洁净度等级有所不同。一般微生物检测通常要求达到万级洁净度；无菌操作区则需达到百级或千级；高洁净度实验如食品微生物实验、药品微生物限度检测等，需达到十万级或更高。

· 功能区域划分：一般分为清洁区，用于准备培养基、洗涤等；操作区，包含无菌操作台和半无菌操作台，用于微生物检测和实验操作；污染区，用于废弃物处理和培养物的销毁。同时要合理规划人流、物流走向，避免交叉污染。

· 温湿度控制：温度应保持在 18-26℃之间，相对湿度控制在 45%-65% 之间，以确保微生物培养的稳定性和实验结果的可重复性，需配备温湿度控制系统，并定期检测和记录数据。

· 选择合适的生物安全柜。如一级生物安全柜适用于对人体、动植物或环境具有潜在危害的微生物实验；二级生物安全柜可用于临床、诊断、教学等领域的实验；三级生物安全柜则用于处理具有极高危害性的病原体实验。